银行承兑汇票付款是票据流通的最后环节，付款人付款后收回票据，承兑汇票的法律关系结束。根据《票据法》第六十条：付款人依法足额付款后，全体汇票债务人的责任结束。 但在实际付款业务操作中，付款程序还有以下问题须明确：
1、付款人的审查义务 一般而言，付款人应对银行承兑汇票持票人的资格进行形式上审查，即（1）票据的形式是否合法，绝对记载的事项是否记载齐全；（2）承兑汇票的背书是否连续；（3）提示付款人的合法身份证明或者有效文件。
2、付款人付款后的权利 银行承兑汇票持票人获得付款的，应当在汇票上签收，并将票据交给付款人，付款人如果不收回票据，一旦该票据进入善意的第三人手中，付款人将受到损失。
3、付款人的币种问题 汇票金额为外币的，按照付款日的市场汇价，以人民币支付，汇票当事人对汇票支付另有约定的，按约定支付。
4、逾期付款 付款人在应付日当天无法付款或付清票款，逾期付款天数从承付期满日算起，承付期满日银行营业终了时，付款人如无足够资金支付，其不足部分应当算作逾期1天。计算1天的赔偿金，于次日算2天，依次类推。付款人开户银行对付款人逾期支付的款项，应当根据逾期付款金额和天数，按每天万分之五计算逾期付款赔偿金。